Rozwój technik sekwencjonowania wysokoprzepustowego zrewolucjonizował badania biologiczne i biomedyczne. Jednocześnie wraz z rosnącą liczbą danych rozwijane są również narzędzia bioinformatyczne służące do analizy tych danych. Zajęcia mają na celu poszerzenie wiedzy i umiejętności w zakresie: planowania eksperymentów z wykorzystaniem sekwencjonowania wysokoprzepustowego, technik sekwencjonowania, doboru narzędzi do analizy danych, weryfikacji otrzymanych wyników i interpretacji wyników w świetle zgromadzonej wiedzy biologicznej. W ramach zajęć planujemy zapoznanie uczestników z szeroką gamą programów służących do analizy danych z sekwencjonowania genomów i transkryptomów, które umożliwią kolejne etapy badań i odpowiedź na zróżnicowane pytania badawcze.
Tematem zajęć będą techniki bioinformatyczne służące do badania białek w ujęciu ewolucyjnym. Przedstawiona zostanie wiedza z zakresu warsztatu (Linux, Python) oraz narzędzi do analizy struktur i sekwencji białek. Celem zajęć będzie przekazanie praktycznych umiejętności przeprowadzania zarówno analiz wysokoprzepustowych, nastawionych na opisanie różnorodności i ewolucji całych rodzin białkowych, jak i tych skupiających się na analizie pojedynczych białek, szczególnie w kontekście badań doświadczalnych. Zajęcia skierowane są do osób zainteresowanych poszerzaniem swojej wiedzy z zakresu programowania oraz analizy danych biologicznych.